Amorces et sondes d'amplification

 

Synthetic Genetics fabrique un ensemble de sondes et d’amorces marquées ou non

à la fluorescéine ou à la biotine.

Ci-dessous, sont présentés quelques exemples d’ADN synthétiques qui figurent au catalogue de Synthetic Genetics.

 

Amorces HIV-1 gag (SK38/39) avec la sonde SK19
Amorces HIV-1 gag (P1,2) avec une sonde

Cette paire d’amorces amplifie un fragment de 114 pb dans la région gag du HIV-1. La région du virus choisie est décrite dans Genbank (n° K02007, locus HIVSF2CG). L’expérience a montré que ces amorces détectent la plupart des souches de HIV-1. Pour simplifier les protocoles, les sondes et les amorces sont proposées déjà marquées à la fluorescéine et à la biotine. Chaque trousse contient les amorces 3016 (SK38), 3017 (SK39) et la sonde 5014 (SK19) dirigée contre la position 1551-1665.

Réf.

 Qté Nb de réactions
9007-001 1nmol 50 tests
9007-001F 1 nmol 50 tests
9007-001B 1 nmol 50 tests
9007-005 5 nmol 250 tests
9007-010 10 nmol 500 tests

Cette paire d’amorces amplifie un fragment de 302 pb dans la région gag de la souche LAV du HIV-1. Chaque trousse contient l’amorce 3070 (P1), l’amorce 3071 (P2) et la sonde 5057 dirigée contre la position 764-1066.

Réf. Qté Nb de réactions
9023-001 1nmol 50 tests
9023-005 5 nmol 250 tests
9023-010 10 nmol 500 tests

 

Amorces HIV-1pol gag (extremité 5'), (P3/P4) avec une sonde
Amorces HIV-1 pol (extrémité 3’), (P5/ P6) avec une sonde

La paire d’amorces amplifie un fragment de 388 pb du gène de l’ADN polymérase de la souche LAV du HIV-1. Chaque trousse contient les amorces 3072 (P3), 3073 (P4), 5058 (sonde) dirigées contre la position 2381-2663.

Réf.

 Qté Nb de réactions
9024-001 1nmol 50 tests
9024-005 5 nmol 250 tests
9024-010 10 nmol 500 tests

La paire d’amorces amplifie un fragment de 140 pb du gène de l’ADN polymérase de la souche LAV du HIV-1. Chaque trousse contient les amorces 3074 (P5), 3075 (P6), 5059 (sonde) dirigées contre la position 4085-4225.

Réf. Qté Nb de réactions
9025-001 1nmol 50 tests
9025-005 5 nmol 250 tests
9025-010 10 nmol 500 tests

 

Autres trousses de sondes et d’amorces d’amplification Virus

Virus

Trousses génétiques

 

Oncogènes

HER-2 oncogene

K-ras Cellular oncogene

 

Marqueurs génétiques humains

Beta-Globin

Cystic Fibrosis Delta 508

HLA DQ-alpha locus

Human 18S rRNA

 

Marqueurs génétiques bactériens

E. coli 16S rRNA

PBR322 control

EBV BamW

EBV IR3

HBV, antigène de surface

HBV-187, antigène de surface

HBV-429, antigène de surface

HCMV glyB

HCMV gp64

HCMV IE1

HCMV (LA1/6)

HCMV (MIE)

HCMV pol

Herpes Simplex Virus Type 1 & 2 pol

HIV-1 env

HIV-1 gp41

HIV-1 LTR

HIV-1 ARNm épissé in vitro

HIV-1,2 gag

HIV-2 LTR

HPV E6 orf Type 16 et 18

HTLV-1 gag-pol ORF

HTLV-1 pol Gene

HTLV-1 pol

HTLV-I,II pol

HTLV-I,II px(tax)

HTLV-II pol

Human Herpes Virus Type 6

Varicella Zoster 44 kD protein

 

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